Shrek, hayatını değiştirecek zorlu bir seçimle karşı karşıyadır. Kral Harold hastalanınca tahtın yeni sahibi belirlenmek zorunda kalır. Shrek için tek çözüm, Fiona’nın kuzeni Prens Artie’yi geleceğin kralı olarak hazırlamaktır. Ancak bu sırada Prens Charming, intikam için kötülerden oluşan bir orduyla krallığı tehdit eder. Shrek, Eşek ve Çizmeli Kedi Artie’yi eğitmeye çalışırken; Fiona, annesi ve prenses dostları da Charming’in saldırısını durdurmak için mücadele verir. Eğer başarılı olamazlarsa, krallığın ve Artie’nin geleceği sonsuza dek yok olacaktır.
