New Mexico'nun dağlık sınır bölgesinde görev yapan askerler, bilimsel araştırmalar yürüten bir ekibe malzeme ulaştırmakla görevlendirilir. Ancak araştırma kampına vardıklarında bilim insanlarının hiçbir iz bırakmadan kaybolduğunu fark ederler. Bölgede bulunan gizemli bir sinyal, onları dağların derinliklerine doğru ilerlemeye yönlendirir. Burada karşılarına çıkan tehlike, sıradan bir arama kurtarma görevinin çok ötesindedir. Issız tepelerde yaşayan mutantlar, önceki olaylardan daha vahşi ve ölümcül bir tehdide dönüşmüştür. Askerler, kendilerini çevreleyen düşmanların arasında hayatta kalmaya çalışırken bölgenin karanlık sırlarını da keşfetmeye başlar. Tepenin Gözleri 2, kapana kısılmış bir grup askerin acımasız düşmanlara karşı verdiği korkunç yaşam mücadelesini anlatıyor.